Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Sgcz-201ENSMUST00000118896 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms