Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm37669-201ENSMUST00000192184 820 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 AC154527.3-201ENSMUST00000225519 989 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Mcpt4-201ENSMUST00000043249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm3250E9Q1M3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm43255-201ENSMUST00000198885 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm3250E9Q1M3 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms