Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms