Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ankrd34aB2RW11 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ankrd34aB2RW11 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms