Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
H60cB1B213 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms