Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm7781-201ENSMUST00000117258 788 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Zfp961-204ENSMUST00000136516 601 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm16013-201ENSMUST00000152249 353 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm10617-201ENSMUST00000098368 1172 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm17797-201ENSMUST00000182175 997 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm18443-201ENSMUST00000185358 556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Itgb4A2A863 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Faf2-201ENSMUST00000026991 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itgb4A2A863 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms