Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CcniQ9Z2V9 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms