Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Hdac5Q9Z2V6 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac5Q9Z2V6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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