Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn9Q9Z0S7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Cldn9Q9Z0S7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn9Q9Z0S7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn9Q9Z0S7 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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