Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Rabgef1Q9JM13 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms