Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Trim39Q9ESN2 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms