Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pop5Q9DB28 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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Pop5Q9DB28 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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