Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SlirpQ9D8T7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms