Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Chmp3Q9CQ10 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms