Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Q9CPS8 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms