Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Prpf8Q99PV0 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Prpf8Q99PV0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms