Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SrrtQ99MR6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms