Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Gm25319-201ENSMUST00000122552 325 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Pea15b-202ENSMUST00000183185 555 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Olfr1511-201ENSMUST00000078171 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Tex9-214ENSMUST00000184831 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprtQ99M80 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprtQ99M80 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PtprtQ99M80 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PtprtQ99M80 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PtprtQ99M80 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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PtprtQ99M80 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Katnal2-203ENSMUST00000123650 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PtprtQ99M80 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PtprtQ99M80 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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