Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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