Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TrabdQ99JY4 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms