Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rnf144aQ925F3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Rnf144aQ925F3 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms