Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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