Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Tmem63a-201ENSMUST00000027800 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Hoxc12Q8K5B8 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Hoxc12Q8K5B8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms