Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Csnka2ipQ8CH19 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Csnka2ipQ8CH19 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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