Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp27Q8CEG8 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms