Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cwc22Q8C5N3 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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