Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cnot2Q8C5L3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cnot2Q8C5L3 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms