Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm28845-201ENSMUST00000144760 733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Amigo3Q8C2S7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Amigo3Q8C2S7 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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