Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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Atg16l1Q8C0J2 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Atg16l1Q8C0J2 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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