Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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FarsaQ8C0C7 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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FarsaQ8C0C7 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
FarsaQ8C0C7 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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