Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp54Q8BL06 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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