Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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Atg4dQ8BGV9 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Atg4dQ8BGV9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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