Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Atg4bQ8BGE6 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Atg4bQ8BGE6 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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