Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Lrrtm2Q8BGA3 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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