Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Amigo1Q80ZD8 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Amigo1Q80ZD8 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Amigo1Q80ZD8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Amigo1Q80ZD8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Amigo1Q80ZD8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Amigo1Q80ZD8 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Amigo1Q80ZD8 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Amigo1Q80ZD8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Amigo1Q80ZD8 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Amigo1Q80ZD8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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