Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Dsg1bQ7TSF1 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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