Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nek5Q7TSC3 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Nek5Q7TSC3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nek5Q7TSC3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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