Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ckap2lQ7TS74 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms