Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tmeff1Q6PFE7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms