Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN3

Ttbk1, Tau-tubulin kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttbk1Q6PCN3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm20802-201ENSMUST00000190832 698 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ttbk1Q6PCN3 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ttbk1Q6PCN3 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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Ttbk1Q6PCN3 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ttbk1Q6PCN3 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms