Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ParpbpQ6IRT3 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms