Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nop58Q6DFW4 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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