Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pkp4Q68FH0 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms