Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Atg9aQ68FE2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atg9aQ68FE2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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