Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnna3Q65CL1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnna3Q65CL1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnna3Q65CL1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnna3Q65CL1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnna3Q65CL1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnna3Q65CL1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnna3Q65CL1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnna3Q65CL1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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