Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ifit1Q64282 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ifit1Q64282 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ifit1Q64282 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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