Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Taf6Q62311 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Taf6Q62311 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Taf6Q62311 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms