Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 AC115784.1-201ENSMUST00000227687 1010 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Cd47Q61735 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cd47Q61735 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cd47Q61735 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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