Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Piga-204ENSMUST00000133813 1086 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Fxyd1-201ENSMUST00000039909 620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Olfr1060-ps1-201ENSMUST00000118335 943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Mir8104-201ENSMUST00000185165 101 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf608Q56A10 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Stmn3-201ENSMUST00000103045 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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Znf608Q56A10 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 3110083C13Rik-202ENSMUST00000224786 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm14571-201ENSMUST00000118292 570 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf608Q56A10 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms