Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm12961-201ENSMUST00000120507 1050 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sf3b2Q3UJB0 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms